在云南，它主要生长在分布于滇西北的丽江、剑川、洱源、大理洱海和中南部东川、昆明滇池、江川、石屏等地，在四川西南部的布拖，贵州中部的贵定、平塘至西南部的安龙、威宁，广西北部永福、西部靖西、德保、中部都安和海南省的文昌等地，也有分布。 海菜花主要生于海拔2700米以下湖泊、池塘、沟渠和深水田中。但目前在多数受污染的高原湖泊如滇池（云南昆明）、异龙湖（云南石屏）、杞麓湖（云南玉溪）等湖泊中已绝灭。

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